Организмы, населяющие различные области суши и акватории, различаются по составу и могут быть решены различными способами в зависимости от концепций, подходов и методов, которые вы приняли для определения этих различий.

Флористические и фаунистические исследования являются начальным этапом биогеографического исследования различных регионов. Здесь используются различные понятия и термины. К их числу мы относим термины: флора и фауна. Флора и фауна виды растений и животных, принадлежащие к родам и семействам в определенном регионе. Биота представляет собой совокупность флоры и фауны того или иного региона.

Данные термины используются при описании не только совокупности растений, животных, микроорганизмов, но и крупных подразделений растительного и животного мира. Соответственно это:

- флора водорослей – альгофлора;

- флора споровых растений, папоротников, грибов – микрофлора;

- фауна млекопитающих – териофауна;

- фауна птиц – орнитофауна;

- фауна насекомых – энтомофауна и т. д.

В анализе состава и разнообразия таксонов, их происхождения и пространственно-временных соотношений большую помощь оказывают данные о видовом составе растений и животных.

Например, растительный мир острова Мадагаскар насчитывает около 6000 видов сосудистых растений, среди которых 9 эндемичных семейств, не менее 450 эндемичных родов, эндемизм видов достигает 89 %; флора характеризуется разнообразием пальм, бамбуков, орхидей, существует несколько видов баобабов.

Если рассматривать животный мир Мадагаскара, то в нем представлены полуобезьяны, состоящие из 21 вида, виверра с всего 7 эндемичных родов от хищников, эндемичная подсемейство мадагаскарских хомяков от грызунов; среди птиц можно рассмотреть три эндемичных семейства с 11 видами.

Историческое развитие местного растительного и животного мира связано с процессами видообразования, вытеснения некоторых видов, их миграции и вымирания. Различия между флорой и фауной в целом объясняются характерной геологической историей каждого региона. Основа исторической биогеографии объясняется анализом флоры и фауны во времени и пространстве, который, в свою очередь, показывает, из каких таксономических групп, каким образом и в какое время возникла та или иная современная или ископаемая флора и фауна.

Биота меняется не только из-за изменений в окружающей среде, но и из-за внутренних причин, характерных для всех живых существ – филетической эволюции, то есть изменения генотипа и фенотипа по времени, благодаря чему каждый вид, род, семейство и любой другой таксон живут на Земле только в течение ограниченного времени и постепенно превращаются в новые виды, роды или семейства.

Одной из наиболее важных географических (хорологических) характеристик, используемых при анализе растительного и животного мира, является часть земной поверхности или акватории, популяция определенного вида или другого систематического таксона живых организмов, которая постоянно присутствует в течение достаточно длительного периода времени.

Экологическая биогеография, исследующая закономерности распространения сообществ, создаваемых совместно обитающими растениями, животными, микробами, предлагает другой путь анализа фаун и флор. Сообщества (ценозы) отличаются друг от друга как по составу и количеству видов, так и по особенностям их строения.

В любом биоценозе выделяют растительные сообщества (фитоценоз), население животных (зооценоз), сообщества микроорганизмов. Термин «сообщество» многогранен. Это означает, что общий лес, хвойный лес и зеленый лес ели могут быть определены как сообщества. При изучении закономерностей распространения сообществ большое значение имеет выявление их структуры и различий в различных регионах и эколого-географическом положении.

Простейшей единицей дифференциации земель в экологической биогеографии является биогеоценоз – однородный участок земной поверхности с определенным составом живых и косых (атмосфера, почва, подстилающие породы, вода) компонентов, объединенных обменом веществ и потоком энергии в единую систему.

Границы биогеоценоза обозначаются растениями, которые являются одним из важнейших и легко делящихся компонентов биогеоценоза. На зональном уровне часто используется термин «биом», который отличается от физиогеоценозов зональных растений, представляющих собой совокупность физиогеоценозов зональных растений: тундры, тайги, смешанные леса и т. д. в сходных биомах разных континентов существуют разные биоты.

Например, условия обитания лиственных лесов европейской части России и восточной части Северной Америки схожи. Однако при значительной близости происхождения и строения сообществ в их состав входят различные виды растений и животных.

Пространственная структура сообществ и их возникновение формируются под влиянием сходства условий окружающей среды, а флора и фауна характеризуются закономерностями их развития и распространения.

В биоте широколиственных лесов Северной Америки сосредоточено значительное богатство видов, которое в основном определяется условиями, существовавшими на континенте в предыдущие геологические эпохи, и современным ландшафтным строением территории.

В современной биогеографии сформировались основные подходы к изучению живого слоя планеты: флористико-фаунистический, экологический, исторический, региональный. Одним из важнейших методов, используемых при решении биогеографических задач, является картографический. Биогеографические карты являются основным инструментом географического анализа распространения биот и сообществ.

Свой вклад в развитие биогеографии внесли исследователи различных научных школ и направлений: франко-швейцарской, скандинавской, англо-американской и др., среди которых российская школа имеет ярко выраженные достижения и собственные подходы как в биогеографии, так и в ботанической географии, зоогеографии земли и океанической биогеографии.

В настоящее время в биогеографии сформировано несколько самостоятельных разделов, в том числе биогеография Мирового океана, пресноводные воды, ботаническая география и зоогеография суши, биогеографическая картография, биоиндикация, геногеография, география биологических ресурсов и др. [2].