Возбудители болезни – Alternaria alternata (Fr.) Keisl., (син.:  Alternaria tenuies Nees), Bipolaris sorokiniana Sacc. (син.: Helminthosporium sativum P. K. et. В.).

Заболевание развивается на зародышевой части и проявляется в виде темных пятен различной величины, особенно заметно в годы с высокой влажностью воздуха в период налива зерна. В зависимости от видового состава возбудителя различаются альтернариозный и гелминтоспориозный тип «черного зародыша». При гельминтоспориозной инфекции мицелий гриба проникает в зародыш и щиток, формируются щуплые семена с низкой лабораторной всхожестью, при их прорастании всходы поражаются корневой гнилью. Установлено, что инфицирование пшеницы грибом H. sativum происходит в период цветения – восковой спелости зерна. При альтернариозном «черном зародыше» гриб локализуется в оболочке зерна, эндосперме и алейроновом слое, всхожесть семян не снижается (Кузьмина, 1977).

Изучение  этиологии  «черного  зародыша»  пшеницы  на Северо-Востоке Казахстана показало, что гриб A. tenuiеs находится в плодовой оболочке, не проникает в ткань зародыша.

«Черный зародыш» зерна – широко распространенное заболевание пшеницы в Казахстане, особенно в северном и восточном регионах.

При  температуре 20–25 °С инкубированные во влажной камере семена через 5–7 суток покрываются  обильным темно-оливковым или сероватым налетом, состоящим из мицелия и спороношения гриба. По морфологии  конидии легко можно их идентифицировать: у видов Alternaria они в длинных или короткихцепочках, яйцевидные, обратно–грушевидные, с поперечными и продольными перегородками, размером 20–63 × 9–18 мкм, короткой шейкой (рисунок 63). У B. sorokiniana конидии одиночные, имеют только поперечные перегородки, прямые, обратно-яйцевидные, размером 14–34 × 20–130 мкм (рисунок 64).

Рисунок 63 – Конидии Alternaria tenyies

Рисунок 64 – Конидии Bipolaris sorokiniana