Гендік инженерия қалыптаса бастағаннан бері ғалымдар биологияның жаңа саласының дамуына байланысты, ықтимал қауіп пен этикалық мәселелерді ескеру қаншалықты маңызды екенін түсінді.
Сатуға рұқсат етілген бірінші тағам трансгенді қызанақ болды. Қоғамда бұл трансгенді тамақ өнімдерінің қауіпсіздігі туралы пікірталас тудырды. Негізгі мәселелердің бірі түрлендірілген қызанақтардың геномындағы трансформацияланған жасушаларды анықтау үшін маркер рөлін атқаратын, канамицин антибиотигіне төзімді генінің болуына байланысты. Мұндай қызанақтың жемістерін тұтыну нәтижесінде, антибиотикке төзімділік гені адамның ішегінде тұратын Escherichia coli бактериясының геномына енуі мүмкін. Бактериялар нәжіспен бірге организмнен шығарылатындықтан, ген қоршаған ортаға таралып, адам организміне енгеннен кейін антибиотиктерге төзімді болатын, басқа патогендік бактерияларға берілуі мүмкін. Алайда, шын мәнінде, қызанақ гені барлық ДНҚ-мен бірге адамның ас қорыту жолында ыдырайды. Бұл болмаса да, геннің организмдер сериясынан өту мүмкіндігі өте аз. Сонымен қатар, кейбір антибиотиктерге төзімді гендер, өкінішке орай, қоршаған ортада кең таралған.
Модификацияланған өсімдіктерге ұқсас тағы бір мысал – өндіріске енгізілген, құрамында бактериялық гені бар жүгері, бұл ген оның зиянкестер мен ауруларға төзімділігін арттырады, сонымен қатар ампициллин антибиотигіне төзімділіктің маркер гені болып табылады. Қоғамдық наразылықтарға байланысты зерттеушілер трансформациядан кейін қажетсіз маркер гендерін жою жолдарын іздеуде. Трансгенді өсімдіктер туысқан арамшөптермен будандасу арқылы, оларға гербицидтерге, ауруларға, құрғақшылыққа және басқа да қолайсыз факторларға төзімділікті таратады деген теориялық мүмкіндік бар. Нәтижесінде мысалы олармен күресу өте қиын болатын және ауылшаруашылық жерлерін толтыратын трансгенді супер арамшөптер пайда болуы мүмкін
Қорқынышқа қарамастан, көптеген елдерде генетикалық түрлендірілген организмдерді өсіру және пайдалану көлемі артып келеді. Осы уақытқа дейін адам денсаулығына, үй жануарларына және жалпы биосфераға айтарлықтай зиянды әсер тіркелген жоқ.
Адамдар көбінесе басқа организмдерді өз пайдасы үшін модификациялауға құқылы деп санайды. Алайда, соңғы кездері мұндай антропоцентризм барған сайын көп сынға ұшырауда. Сонымен қатар, зертханалық жануарлардың геномына адам гендерін енгізу неге әкелетіні белгісіз, бұл әдіс көптеген адам ауруларының молекулалық механизмдерін зерттеу үшін кеңінен қолданылады.
Дегенмен, ауыл шаруашылығы, фармакология және медицина қажеттіліктері үшін генетикалық түрлендірілген жануарларды шығару, қазіргі өмірдің шындығы болып табылады және генетиктердің одан әргі күші адам мен биосфера үшін трансгенді организмдердің қауіпсіздігін қамтамасыз етуге бағытталуы керек.
Долли қойын клондау генетика мен биотехнологияның дамуының сөзсіз салдары болды. Қажетті белгілері бар жануарлардың көптеген бірдей көшірмелерін жасау мүмкіндігі пайда болды. Клондау адамға қатысты да жүзеге асырылуы мүмкін, бірақ сонымен бірге бірқатар этикалық мәселелер туындайды. Сондықтан бұл бағытта ғылыми зерттеулерге тыйым салынған.